گردش کار صدور مجوز تولید نهال گواهی شده به شرح زیر می باشد:

1. ارائه درخواست متقاضی به مدیریت باغبانی استان
2. طرح موضوع درخواست در کمیته فنی نهال استان
3.  بازدید کمیته فنی نهال از محل ارائه شده ، بررسی وامکان سنجی با توجه به نتایج آزمایشات آب و خاک
4. انعکاس موضوع به معاونت تولیدات گیاهی
5. ارجاع درخواست به مؤسسه تحقیقات ثبت و گواهی بذر و نهال جهت بررسی و تایید نهایی، صدور مجوز احداث و تولید نهال گواهی شده

​