نظام بذر گواهی محدود (Partially Certified Seed System) نوعی نظام هوشمند محلی است که در محل تلاقی نظام غیررسمی یا محلی (Local or informal seed system) با نظام رسمی (Formal seed system) استقرار یافته و مزیت­های آن را گسترش می­دهد. این برنامه زنجیره­ای از فعالیت­ها را ایجاد می­کند که محصول نهایی آن بذر دارای تاییدیۀ کیفیت فیزیکی، فیزیولوژیک و سلامت بذر است. زنجیره فعالیت­های تولید بذر در نظام بذر رسمی یک اکوسیستم باز ایجاد می­کند که با اصلاح یک رقم زراعی جدید آغاز می­شود. در حالیکه، در نظام بذرگواهی محدود، یک چرخه بسته­ ایجاد می­شود که با شناسایی توده­ بومی یا رقم محلی ایرانی واجد ارزندگی­های اگرواکولوژیک شروع شده و با کشت همان محصولات بذری در دورۀ تولید بذر بعد بهبود پیدا می­کند و به پایداری اکوسیستم وفادار است. بدلیل ماهیت متنوع ریخته ارثی این منابع، استانداردهای گواهی محدود و دستورالعمل­های حاصل از آن، شامل تایید اصالت و خلوص ژنتیکی رقم نمی­شود ولی کیفیت فیزیکی و فیزیولوژیک مطلوب بذر را تضمین می­نماید.